אטום ויסוד זה אותו הדבר?

לא.
יסוד זה חומר שהוא טהור, ההפך מתרכובת.
אטום זה כל האטום עצמו, שזה עשוי מפרוטונים, אלקטרונים וניוטרונים.

לא